BEA says that the area where the plane was found had been researched in the early phases by sonar. Nothing was detected then, and that is why they had privileged other sectors in later searches.
In French:
Les recherches de détection acoustique des balises installées sur l’avion, et
devant émettre un signal pendant 30 jours au moins, ont donc eu pour objet
d’explorer en priorité la zone se trouvant le long de la trajectoire prévue de l’avion
et, en fonction du temps et des ressources disponibles, la plus grande surface
possible du Cercle. La zone où l’épave a été découverte avait donc bien été
explorée par ce moyen, sans détecter les balises. Les raisons de cette non détection
vont maintenant être recherchées.
http://www.bea.aero/fr/enquetes/vol....la.phase.4.pdf
It is said that they don't know why the pingers where not detected and will have to look in to this.
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